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 Python入门到底有多简单（一）：数据读写与输出


生信团 上海天昊生物

    很多人觉得数据分析入门很难，但随着B站和公众号上的学习资源越来越多，学习数据分析已经变得非常简单。以下面为例，从一张规则的表格中，根据门水平名称，生成对物种门水平的表格文件。

 

一

导入pandas包


In [1]:
import pandas as pd

 

二

读取数据


读取文本文件pd.read_table，读取excel文件，
可以用df = pd.read_excel('*.xlsx',sheet_name='*')。

In [2]:
df = pd.read_table('subsample_otu.tax.0.03.xls')

如下图所示，门水平有12个门的数据。



 

 

 

三

查看待拆分的门


In [3]:
df['phylum'].unique()

Out[3]:
array(['Acidobacteria', 'Actinobacteria', 'Armatimonadetes',
     'Bacteroidetes', 'Chloroflexi', 'Firmicutes', 'Fusobacteria',
     'Gemmatimonadetes', 'Planctomycetes', 'Proteobacteria',
     'Spirochaetes', 'Synergistetes'], dtype=object)
 
 
四
生成Excel文件

根据门水平名称，提取对应门水平的信息，并生成以门水平名称命名的Excel文件。
In [4]:
for i in df['phylum'].unique():    
     df[df['phylum']==i].to_excel(i+".xls",index=False)

Out[4]:


 

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作者：大熊
审核：有才
来源：天昊生信团
 
 
 
 
 
 
 
 


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