多样性数据提交，以往都是通过NCBI的SRA进行提交，网上也能找到不少推文介绍如何提交。但SRA提交等待周期较长，遇到提交问题联系工作人员的话，需要等第二天才能收到邮件回复，反复沟通的话，时间耗不起。中国科学院北京基因组研究所（国家生物信息中心）开发的中国核酸数据库GSA（组学原始数据归档库），是最近数据提交的新选择，提交最快当天即可获取登录号，且提交过程中的任何问题都可以通过网站（https://bigd.big.ac.cn/gsa/）联系工作人员进行一对一指导，群工作时间是工作日9:00-17:00。建议使用Chrome浏览器（别问为什么，遇坑后工作人员给的解决方案）。
 

 

一

注册账号

 

登录 https://bigd.big.ac.cn/gsa/ ，进入主页，点击Sign in，通过邮箱注册账号。

 

二

项目信息BioProject填写

 

1. 新建BioProject

登录 https://bigd.big.ac.cn/gsub/ ，点击Bioproject。

点击新建BioProject，

跳转至https://bigd.big.ac.cn/gsub/submit/bioproject/list

 

2. BioProject信息填写

点击新建BioProject,

跳转至

https://bigd.big.ac.cn/gsub/submit/bioproject/new ，开始项目信息提交

• ①提交者信息

 

• ②基本信息

 

• ③项目类型

 

• ④出版信息

 

• ⑤概况信息（核查）

 

三

样本信息BioSample填写

 

回到主页 https://bigd.big.ac.cn/gsub/ ，点击BioSample

1. 新建BioSample

 

2. BioSample信息填写

点击新建后，开始BioSample信息填写。

• ①提交者信息

 

 

• ②基本信息

 

• ③样本类型

 

• ④样本属性

下载文件，并填写。（填写见后面 3. MetagenomeMIMS.me_soil.cn.xlsx 表格填写）

 

• ⑤概况信息（核查）

 

3. MetagenomeMIMS.me_soil.cn.xlsx 表格填写

示例文件填写信息转置后，如下图所示：

填写完成后，上传文件并进行校验，确认无误进入下一步，核查没有问题，点击提交，BioSample提交完成。

 

四

原始数据GSA提交

 

回到主页https://bigd.big.ac.cn/gsub/ ，点击GSA，如下图所示

 

1. 新建GSA

 

2. GSA信息填写

• ①提交者信息

 

• ②基本信息

 

• ③元数据信息

实验部分填写示例（表Experiment）

原始数据信息填写示例（表run）

上传填写好的文件，校验无误后点击下一步

 

• ④文件上传

如上图所示，连接主机，输入用户名和密码，点击右侧的GSA，将本地文件拖拽至GSA目录下，完成数据上传。

 

• ⑤概况信息（核查）

 

 

到此为止，

提交就算结束了，

剩下的就是等待审核通过，

邮件会发送登录号给您。

 

 

 

 

本文相关提交的示例文件参考，

可关注“上海天昊生物”公众号，

回复“多样性数据提交”自动获取！

 

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作者：大熊

审核：有才

来源：天昊生信团

 

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